در طرح مهرآفرین استخدام ۵۰۰ هزار نفر پیش بینی شده بود که در زمان تصویب از سوی دولت در سال ۱۳۹۱، این مصوبه با انتقاد مجلس شورای اسلامی و دیوان محاسبات کشور مبنی بر مغایرت با قوانین کشور مواجه شد اما دولت وقت همچنان اصرار به اجرای آن داشت و در نهایت همان سال نیروهای قراردادی، شرکتی یا نهضتی به صورت پیمانی جذب وزارت آموزش و پرورش شدند و بنا بود این افراد ظرف مدت پنج سال تعیین تکلیف شوند.

اجرای این مصوبه استخدامی در مرداد سال ۱۳۹۲ توسط دولت یازدهم متوقف شد و سپس یک سال بعد معاون اجرایی رئیس جمهور وقت اعلام کرد از آنجا که عده ای به دولت اعتماد کرده و در آزمون استخدامی شرکت کرده اند انصاف نیست آن را لغو کنیم و دستگاه ها می توانند در صورت تامین منابع از محل صرفه جویی بودجه خود نسبت به استخدام این افراد اقدام کنند.

در دی ماه سال ۱۳۹۳ وزیر آموزش و پرورش دولت یازدهم با انتقاد از رویه استخدام در این وزارتخانه اعلام کرد که «در سه ساله آخر دولت قبل مجموعا در کشور ۱۴۸ هزار نفر در آموزش و پرورش استخدام شدند که رقم بسیار بالایی است و سازمان مدیریت اعلام کرده است که ظرفیت استخدام در آموزش و پرورش در سه سال گذشته پیش‌خور شده و امید است بتوانیم طبق ماده ۲۸ اساسنامه دانشگاه فرهنگیان، نیروی مورد نیاز خود را جذب کنیم.»

پس از گذشت چندین سال، نمایندگان مجلس شورای اسلامی در تاریخ ۱۳ اسفند سال ۱۳۹۹ و در جریان بررسی لایحه بودجه ۱۴۰۰ و بخش هزینه‌ای آن با بندهای الحاقی ۴، ۵، ۶، ۷ و ۸ تبصره ٢١ ماده واحده موافقت و وزارت آموزش و پرورش را برای استخدام معلمان طرح مهرآفرین و قرآنی مکلف کردند.

بر اساس بند الحاقی ۴ این تبصره، وزارت آموزش و پرورش و سازمان اداری و استخدامی کشور مکلف شدند نسبت به استخدام معلمان طرح مهرآفرین از محل باقیمانده مجوزهای استخدامی استفاده نشده و همچنین تمامی معلمان قرآنی اقدام کنند و بارمالی ناشی از اجرای این بند از محل ردیف ۱۲۷۵۰۳ وزارت آموزش و پرورش در سقف ۵۰۰ میلیارد ریال تأمین شود.

نمایندگان مجلس شورای اسلامی بار دیگر و در ۱۱ اسفند ۱۴۰۰، در جریان بررسی بخش درآمدی لایحه بودجه سال ۱۴۰۱ کل کشور با بند الحاقی (۲) تبصره (۲۰ ) ماده واحده این لایحه موافقت و دولت را مکلف کردند نسبت به تبدیل وضعیت نیروهای جامانده استخدامی سال های ۱۳۸۸ تا ۱۳۹۲ درطرح مهرآفرین اقدام کند.

براساس این بند الحاقی سازمان اداری و استخدامی کشور و وزارت آموزش و پرورش مکلف شدند نسبت به تبدیل وضعیت، تخصیص شناسه و استخدام رسمی تمامی مشمولان و نیروهای جا مانده و باقی مانده استخدامی سال های ۱۳۸۸ تا ۱۳۹۲ طرح مهرآفرین با اولویت معلمان قرآنی که هم اکنون با وزارت آموزش و پرورش به صورت قراردادی و یا پیمانی همکاری می کنند و همچنین دانش آموزان آسیب دیده با درجه سوختگی شدید ناشی از آتش سوزی در مدارس کشور اقدام کند و بارمالی ناشی از اجرای این بند از محل ردیف ۱۲۷۵۰۳ وزارت آموزش و پرورش در سقف ۵۰۰ میلیارد ریال تأمین شد.

در سال های بعد وزارت آموزش و پرورش اخذ کد شناسایی برای نیروهای مهرآفرین را منوط به شرکت در آزمون استخدامی کرده و اعلام کرد که برای تبدیل وضعیت نیروهای طرح مهرآفرین از پیمانی به رسمی آزمایشی در حال حاضر مجوزی ندارد.

این طرح پس از سال ها مسکوت ماندن بار دیگر در سال ۱۴۰۱ مورد توجه قرار گرفت به گونه ای که در ۹ شهریور همان سال عبدالرضا مصری نائب رئیس مجلس شورای اسلامی در جلسه علنی اعلام کرد که در قانون رتبه‌بندی معلمان هیچ تفاوت و تبعیضی وجود ندارد و دولت باید هر چه سریعتر رتبه بندی معلمان طرح مهرآفرین را اجرا کند.

در ۱۴ شهریور همان سال نیز علی کریمی فیروزجایی عضو هیات رئیسه مجلس شورای اسلامی در این رابطه گفت: عبارت «اجرای حکم رتبه بندی منوط به تکمیل استخدام مطابق قوانین و مقررات خواهد بود» مندرج در آیین نامه اجرایی قانون رتبه بندی معلمان، با نظر هیات بررسی و تطبیق مصوبات دولت با قوانین، مغایر قانون تشخیص داده شد و توسط دولت باید به نحوی اصلاح شود که در هیات مذکور تأیید شود.

وی تأکید کرد: بنابراین اینکه آئین نامه اجرایی قانون رتبه بندی معلمان تا پیش از این شامل معلمان طرح مهرآفرین نمی‌شد، بر اساس این نظر هیات بررسی و تطبیق مجلس، مغایر قانون است و باید اصلاح شود و با توجه به اینکه مغایر قانون بودن این بخش از آیین‌نامه به صورت رسمی از سوی رئیس مجلس به رئیس جمهور ابلاغ می‌شود، هیات دولت باید این آیین نامه را اصلاح و مجدد برای بررسی به مجلس ارسال کند.